La Universidad CAECE fue la primera institución universitaria del país en crear, en el marco de sus actividades de posgrado, un Laboratorio de Inteligencia Artificial y Maestrías en Inteligencia Artificial e Ingeniería del Software, a las que se les agregó una especialidad en Redes.
Se dictaron además diversos cursos de posgrado en Ciencias, en Psicopedagogía y en Informática.
Mas recientemente y en colaboración con la Fundación para el Desarrollo de los Estudios Cognitivos (FUNDEC) se abrió la Maestría de Gestión de Proyectos Educativos.
A partir del año 2000 se crearon nuevas maestrías, especializaciones y cursos de posgrado entre las que se destacan los convenios firmados con:

• Fundación Walter Benjamin
  para ofrecer las maestrías en Comunicación e Imagen Institucional y Comunicación y Creación Cultural.
• Asociación Psicoanalítica Argentina (APA)
  para dos especialidades.