La Universidad CAECE fue la primera institución universitaria del país en crear, en el marco de sus actividades
de posgrado, un Laboratorio de Inteligencia Artificial y Maestrías en Inteligencia Artificial e Ingeniería del Software,
a las que se les agregó una especialidad en Redes, todas vigentes en la actualidad.

Se dictaron además diversos cursos de posgrado en Ciencias, en Psicopedagogía y en Informática.
En 1995 se firmó un Convenio con la Academia del Sur para poner en funcionamiento cuatro maestrías Humanísticas,
que se están desarrollando actualmente, en las áreas de Pensamiento Clásico, Pensamiento Contemporáneo,
Comunicación y Teoría e Historia de las Religiones.

Mas recientemente y en colaboración con la Fundación para el Desarrollo de los Estudios Cognitivos (FUNDEC)
se habilitó la Maestría de Gestión de Proyectos Educativos.
A partir del año 2000 se crearon nuevas maestrías, especializaciones y cursos de posgrado entre las que
se destacan los convenios firmados con:

• Fundación Walter Benjamin
  para ofrecer la maestría en Comunicación e Imagen Institucional.
  
• Fundación para la Evolución del Talento y la Creatividad,
  para la maestría en Psicopedagogía de Dotados y Talentosos.
• Asociación Psicoanalítica Argentina (APA)
  para la maestría en Psicoanálisis y cinco especialidades.

También a partir del año 2000 se instrumentaron las maestrías en Administración Hospitalaria y Sistemas de Salud , Administración en Gestión de Enfermería, Dirección de Empresas (MBA) Y Orientación Vocacional, Profesional y Comunitaria